Muzeul din Călăraşi a luat fiinţă în 1950  într-o casă naţionalizată cu 6 încăperi, situată lângă primărie, pe strada Sf. Nicolae. A început să funcţioneze propriu-zis în anul 1954, având profilul arheologie, ca urmare  creşterii rapide a patrimoniului.

În anul 1981, Secţia Arheologie se transformă în Muzeul Judeţean Călăraşi, iar în anul 1990 devine Muzeul Dunării de Jos. Clădirea este monument de arhitectură de la sfârşitul secolului al XIX-lea şi prezintă publicului numeroase teme arheologice: piese de arheologie (ceramică, figurine antropomorfe şi zoomorfe, vetre, unelte, fragmente de edificii din neo-eneolitic din situl arheologic Sultana - Malu Roşu, plastică antropomorfă de epocă romană, colecţie de opaiţe romane, ceramică smălţuită şi podoabe bizantine de la Păcuiul lui Soare), numismatică antică şi medievală, exponate care ilustrează istoria locală.